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Un de ses descendants, le comte Pierre II, surnommé le Petit Charlemagne pour sa fougue à gouverner, veut s'imposer en pays Chablais. En 1249, il commence la construction d'un château en partie haute d'Evian, de fortifications, concède une charte de franchises à la ville et y installe un octroi sur le chemin qui mène aux cols vers Milan. Un de ses successeurs, le guerrier Amédée V, dit le Grand, devenu douzième comte de Savoie, donne aux habitants, au cours d'un séjour dans sa résidence évianaise, libertés et franchises, le privilège du navage, celui de transporter des marchandises sur le lac et de faire du négoce avec les cités de la rive nord.
On construit à l'est de la ville un quartier pour les marchands, la Villeneuve de la Touvière et une chapelle, Sainte Catherine. Amédée VI, dit le Comte Vert, du fait de la couleur de sa tunique dans les tournois, petit-fils de Pierre II, partage son temps, au XVIe siècle, entre sa cour qui siège à Chambéry et ses résidences d'Annecy, de Thonon et d'Evian.
